В результате таких нумерических (численных) анализов фенотипических признаков были получены классификации лучшего качества с точки зрения объективности и стабильности. При использовании этого метода во второй половине XX в. были построены дендрограммы родства по фенетическим признакам для представителей многих таксономических групп. С помощью методов нумерической таксономии была усовершенствована таксономия многих родов бактерий, принятая до 1960 г., в том числе родов Bacillus, Mycobacterium, Vibrio; были составлены базы данных, представляющие ценность как богатые источники информации по фенотипическим признакам таксонов и полезные для специалистов разных профилей. Период развития нумерической таксономии совпал с появлением хемотаксономии и внедрением большого числа аналитических биохимических тестов, преимущественно методов хроматографии и электрофореза. Данные методы позволили изучать такие специфические химические компоненты клетки, как аминокислоты, белки, сахара и липиды. Они представлены в лекции 10. Лекция 5. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ СИСТЕМАТИКА НА БАЗЕ ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗА Стремительное развитие систематики бактерий приходится на 70-е гг. В это время постепенно накапливаются знания о свойствах ДНК, интенсивно развиваются методы молекулярной биологии, что способствует упрочению гипотезы о классификации бактерий путём сравнения их геномов. В систематике начинают широко использоваться молекулярно-генетические подходы и возникают предпосылки для создания филогенетической (естественной) классификации бактерий. На фоне успешного развития молекулярной биологии систематика становится одной из бурно развивающихся отраслей биологии. Наступает “золотой век” микробной таксономии. Это хорошо иллюстрируется следующей хронологией: 1974 г. – издан Определитель бактерий Берджи (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, в 1977 г. – краткий вариант восьмого издания, русский перевод в 1980 г.), в котором впервые 74 Это привело к поиску иного подхода для определения степени сходства между бактериями. Со второй половины 1950-х гг. параллельно с развитием компьютерных технологий и появлением возможности использования анализа множества переменных в систематику бактерий проник “нумерический” метод. Появилась числовая таксономия (нумерическая систематика), т.е. использование математических методов для классификации организмов на основе сходства их друг с другом. Стимулом для разработки цифровой таксономии в бактериологии стали трудности в управлении большими таблицами сведений о морфологических, физиологических и других свойствах многочисленных штаммов. Появилась необходимость в объективном методе таксономического анализа, цель которого – распределение отдельных штаммов по однородным группам, видам, оформление видов в рода и высшие группирования. Впервые для бактерий нумерическая таксономия применена была Питером Снитом (Sneath P.H.A., 1923‒2011). В 1957 г. он предложил для анализа большого количества признаков использовать метод нумерической таксономии Адансона. При этом были использованы принципы, предложенные французским ботаником Мишелем Адансоном (Adanson M., 1727‒1806) для классификации объектов. Во второй половине XVIII в. (1763 г.) Адансон впервые высказал мысль о возможности классифицировать животных и растений по совершенно иному признаку. Идея заключалась в том, что все признаки считаются равноценными, при описании исследуемого объекта используется максимальное количество (не менее 50) признаков, мера сходства устанавливается на основании количества совпадающих признаков и выражается в виде коэффициента сходства. Главная идея: все признаки считаются равноценными, и мера их родства определяется числом их совпадений. Коэффициент сходства для двух сравниваемых штаммов получают путём определения отношения числа одинаковых признаков к общему числу изученных признаков. Значение коэффициента сходства меняется в диапазоне от 1 (полная идентичность) до 0 (несовпадение ни по одному изученному признаку). Классификация, построенная на принципах М. Адансона, – трудоёмкий процесс, своё развитие и практическое применение 71