похожи на микромицетов; третьи – на дрожжи; четвертые – цианобактерии – на водоросли; пятые – крупные подвижные бациллы – на ресничные инфузории и т.д. Поэтому на разных этапах развития микробиологии бактерий поочередно относили к царствам Protista, Fungi, Plantae и Animalia. При этом исследователи не находили ответа на вопрос “Что есть бактерия? (лат. Quid est bacterium?)” и не могли чётко объяснить, чем бактерии отличаются, например, от инфузорий или дрожжей-сахаромицетов. На практике в микробиологии господствовал такой подход, когда группировка бактерий по сходству подразумевала и родство. Было предложено множество “естественных” систем на основе фенотипического сходства (например, систематика истинных бактерий и актиномицетов Н.А. Красильникова, систематика спорообразующих дрожжей В.И. Кудрявцева, основанные на сходстве морфолого-физиологических свойств, филогенетические связи которых лишь предположительны), многие из которых не выдержали проверки временем. Развитие молекулярной биологии позволило обратиться к прямому сравнительному изучению генотипа (генома) бактерий и открыло ряд новых подходов к характеристике организмов: определение молярного процента (мол. %) в ДНК, ДНК-ДНК гибридизация, изучение родства на уровне трансляции генов и т.д. Использование методов анализа семантид существенным образом повлияло на развитие эволюционных представлений в микробиологии. Но оказалось, что эти методы имеют свои ограничения, не позволяющие сравнивать организмы, находящиеся в отдалённом родстве. Впервые фактическое обоснование концепции прокариотов и эукариотов было предложено Стениером и ван Нилем в 1962 г. в статье под названием “Концепция бактериума” [Stanier, van Niel, 1962]. Эта работа построена на сравнении 2 типов клеточной организации с целью демонстрации их сходства и различий. По мнению авторов, особое внимание заслуживают: (1) уникальное функционально-организационное разнообразие прокариотов по сравнению с эукариотами; (2) особенности строения их генетического аппарата; (3) локальная (в цитоплазмати- ними – способности или неспособности к активному движению и фотосинтезу. Так, фотосинтезирующие водоросли относили к растениям. Грибы также были отнесены к растениям ввиду их неподвижности. Подвижные микроскопические организмы – бактерии и простейшие – относили к животным. С накоплением информации о свойствах микроорганизмов становилось всё яснее, что в системе живого мира они могут претендовать на отдельное место. Однако аристотелево деление “растения − животные” оказалось психологически очень устойчивым и просуществовало в неизменённом виде 2 тыс. лет. Только во второй половине XIX в. микроорганизмы (грибы, простейшие, бактерии) были отнесены к различным таксонам высокого ранга. Так, в 1860 г. британский натуралист Джон Хогг (Hogg J., 1800‒1869) предложил выделить одноклеточные в самостоятельное царство Protoctista (Primigenum), т.е. низшие (примитивные) организмы, а в 1866 г. молодой немецкий ботаник, биолог-эволюционист Эрнст Геккель (Haeckel E., 1834‒1919) в своей публикации “Всеобщая морфология организмов” (нем. “Generelle Morphologie der Organismen”) выделил все микроорганизмы ‒ простейшие, водоросли, грибы и бактерии – в одно царство Protista (протисты, первосущества). Общий отличительный признак протистов − простота биологической организации, отсутствие внутренней дифференциации на различные типы клеток и ткани, что характерно для растений и животных. Выделение микроорганизмов в самостоятельное царство означало утверждение идеи их биологической индивидуальности и их самостоятельного исторического развития, независимого от растений и животных. Дальнейшее изучение геккелевских протистов с использованием развивающихся методов световой (позднее электронной) микроскопии и цитохимии выявило гетерогенность (неоднородность) этой группы, существенные различия в строении клеток микроорганизмов. На рубеже XIX−XX вв. окончательно стало ясно, что бывают клетки с ядром и клетки без ядра. То, что “ядерный” критерий исключительно важен для мегасистематики, первым понял немецкий ботаник и бактериолог Фердинанд Кон (Cohn F., 138 135