нения. В 1950-х гг. параллельно с развитием компьютеров появилась числовая таксономия, позволившая проводить сравнительный анализ большого количества фенотипических признаков для большого количества штаммов [Sokal, Sneath, 1963]. Матрицы данных, демонстрирующие степень сходства между каждой парой штаммов, и кластерный анализ, в результате которого получают дендрограммы, выявляют общую картину фенотипической последовательности (связности) индивидуальной группы штаммов. Поскольку большое количество признаков отражает существенное количество генотипической информации, то вскоре стало очевидным, что числовой анализ большого количества фенотипических характеристик действительно имеет таксономическую значимость. В реестр признаков, позволяющих идентифицировать бактериальные культуры, наряду с морфологическими и, физиологическими, заносятся экологические признаки, т.е. физиологические признаки, имеющие экологическое значение. Это признаки, отражающие особенности местообитания, например, наличие симбиотических или паразитических взаимоотношений микроорганизмов с окружающей природной средой, способность к усвоению нормальных алканов и ароматических углеводородов, труднодоступных для многих микроорганизмов, или способность к диауксотрофии, олигокарбофилии и олигонитрофилии – свойства, обеспечивающие приуроченность отдельных групп к специфическим местообитаниям, таким как биотопы с повышенным содержанием минеральных солей, биотопы районов нефтяных загрязнений и нефтепромыслов. Наиболее полно задача быстрой идентификации прокариотов решается с помощью Определителя бактерий Берджи (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology), который играет роль современного пособия для идентификации бактерий, базы данных. Основная идея классификации “по Берджи” ‒ лёгкость идентификации бактерий по совокупности фенотипических и генотипических признаков. В девятом издании Определителя (1984‒1989) бактерии разделены на 4 основные категории (отделы) и 35 групп, выделенные на основании строения “пограничного слоя клетки” и результатов окрашивания по Граму. Эти группы не являются формальными таксономическими рангами, а представляют легко узнаваемые фенотипические группы, удобные для диагностических целей. Отдел 1. Gracilicutes (от лат. “gracilis” – тонкий, “cutes” – кожа) – грациликутные или тонкостенные организмы (1‒16 группы). Сюда отнесены грамотрицательные эубактерии, имеющие клеточную стенку. Размножение – бинарное деление, почкование или множественное деление. Спор не образуют. Многие подвижные: жгутики или скольжение. Аэробные и анаэробные или факультативно анаэробные. Отдел включает классы Anoxyphotobacteria, Oxyphotobacteria и 9 секций, сюда относят группы спирохет, спирилл и род Bdellovibrio – паразитирующий в клетках других бактерий, палочки и кокки, риккетсии и хламидии. Отдел 2. Firmicutes (от лат. “firmis” ‒ прочный) – грамположительные эубактерии, имеющие клеточные стенки (17‒29 группы). Толстостенные кокки, палочки или нитчатые формы. Размножаются бинарным делением. Некоторые образуют эндоспоры, у других – споры на гифах или в спорангиях. Передвигаются с помощью жгутиков, но большиство неподвижны. Аэробы, анаэробы, факультативные анаэробы. По морфологии разделены на два класса: Firmibacteria (кокки, палочки, неветвящиеся формы) и Thallobacteria (ветвящиеся формы). Отдел 3. Tenericutes (от лат. “tener” – мягкий, нежный) – мягкостеночные организмы. Эубактерии, лишённые клеточных стенок (30-я группа). Клетки окружены цитоплазматической мембраной, плеоморфны. Размножение – бинарным делением, почкованием, фрагментацией. По Граму окрашиваются отрицательно. Характерно образование мелких, врастающих в агар колоний. Могут быть сапрофитами, паразитами или патогенными формами. Представлены одним классом Mollicutes. Входят микоплазмы. К молликутам относят эндосимбионтов простейших грибов. Отдел 4. Mendosicutes (от лат. “mendosus” – ошибочный) – архебактерии, клеточные стенки которых отличаются от аналогичных структур прокариотов (31‒35 группы). Клетки разной формы – кокки, палочки, нити. Многие плеоморфны. Большинство имеет клеточную стенку, но она не содержит типичного пептидогликана, может быть построена только из белковых макромолекул или гетерополисахаридов. По Граму окрашиваются и отрицательно, и положительно. Большинство – строгие анаэробы, 216 217